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如何进行标签SNP的选择

来源:www.ahlulin.com   时间:2023-07-30 07:28   点击:224  编辑:admin   手机版

如何进行标签SNP的选择

SNP是分布在动物基因组中非常常见的一种分子标记。在人体中每1000bp就可能有一个SNP。需找SNP的目的是为了做连锁分析,在现在先进的技术里,还可以做全基因组关联分析(GWAS)。

然后说说标签SNP,这个涉及到单倍型的问题(对单倍型稍微讲解一下!三个SNP假定是G、C突变,G、T突变和A、T突变,但不是说这些突变在单倍体染色体上里是随意组合的,而是趋向于一种组合方式,比如一条染色体是GGT,另一条是CCA)。因为在基因组中,有些区域是较为紧密连锁在一起的,这个区域可大可小,组成一个单倍型框,在区域里也会存在多多少少的SNP。人们没有必要把这些SNP都找出来,因为它们往往就像是捆绑在一起的。于是从中选出一个代表性的SNP,它可以反映这个区域的情况。然后就方便人们继续做关联分析!继人类基因组计划之后,还做了单倍型的图谱。这也是标签SNP的应用。讲的够清楚吧,呵呵……希望理解,。

动物标本是怎样制成的?

1.动物干制标本制作 [1]昆虫成虫标本的制作方法 制作昆虫标本前应先将昆虫处死,简单的处死方法是用乙醚熏或向体内注射甲醛。 (1)针插法 这是固定昆虫的一种最简单实用的方法。用昆虫针将昆虫插在插针板上来整形,晾干制成标本。插针板用质地疏松的薄板做成。插针的位置,随昆虫的大小和种类而不同。然后用镊子将触角、足和翅的姿态纠正好,分别用大头针固定。 (2)展翅法 制作鳞翅目和蜻蜒目等成虫时要用展翅法。 a.简易展翅板的制作:将厚2cm以上的泡沫塑料板裁成长约33cm,宽约10cm的长方块。在板的中间按所采昆虫身体的大小挖出一条槽,使昆虫胸腹部正好放在里面。 b.展翅槽 取蛾、蝶时不能触及翅的正面,防止掉鳞片。用昆虫针或大头针在虫体胸部背面正中处垂直插入,上方留出约0.7cm,然后将针插在展翅板槽的中间,使头、胸腹部正好位于槽内,翅的基部与展翅板上面一样高。用镊子轻夹蝶翅,使翅向左右展开,前翅轻缓向头前方向拉伸,使前翅后缘与同侧展翅板边呈垂直状。此时用一组纸条将前翅压好,并在翅近前缘、后缘处各插上一个大头针,使前翅固定(注意大头针不要插在翅上)。前翅固定后,用镊子夹取后翅,缓缓移动,使后翅前缘与前翅后缘相接处略呈平行,并用纸条固定,置通风处阴干。 有些昆虫如蛾类(包括蛹)、螳螂、蝗虫等腹部胀大、饱满,制成的标本干燥、缩瘪后极易发霉变质。可在这些昆虫的腹部用剪刀剪开一个口,用镊子取出内脏,用药棉将内壁擦拭干净,用药棉捏成跟腹部相似的棉球,蘸上樟脑粉,塞进腹部内,用镊子将腹腔壁切口合拢。然后将昆虫放在插针板上,用昆虫针插入胸部,并整理好触角和脚的姿势,干燥后即可。 蜻蜒目昆虫腹部长而腹腔壁薄,制成标本后易断裂,所以要用细竹丝从蜻蜒的尾尖插入,穿过腹部和胸部,一直穿到头部,然后剪去尾尖露出的竹丝。这样处理的蜻蜒就挺直坚硬。 (3)胶粘法 小型昆虫如蚊、家蝇、蚜虫等不能插针,可用昆虫针尖沾少量聚醋酸乙烯胶,零星涂在台纸的中央。用镊子轻轻夹住昆虫,粘在台纸上,用针整理触角、足和翅。再用昆虫针将昆虫同台纸一起固定在木板上。制成标本后,在台纸边缘上撒上樟脑粉,阴干。 [2]无脊椎动物干制标本制作 (1)海星标本的干制 海星由海中采集后,要放在有海水的桶中。首先用泻盐(MgSO4)进行麻醉,一般是把泻盐未放在水面上。经过麻醉后的海星放入福尔马林里杀死。1―2小时后从福尔马林内取出,使它腹面朝上,放在烈日下曝晒4―5小时,等略微干燥后,再翻过来晒背面。这样连晒几天,直到干透,或用红外线烘箱烘干。在玻面纸盒的底部撒上些樟脑粉,然后铺垫药棉,再放入干的海星,在盒旁贴上标签,盖好盒盖。 (2)贝壳标本的干制 将腹足纲、瓣腮纲等软体动物材料采回后,放在沸水里约6分钟。取出材料,用针或钩针拉出壳内的肉。如果有部分肉残留,材料再浸在沸水里5―6分钟,用手振动,使残肉同水一同由壳内流出,如果残肉再不出来,要换水反复多浸几次。要使贝壳壳面光泽,可以将贝壳在温热的4―5%稀盐酸里浸泡几分钟,然后取出用水冲洗擦干净,揩上一层光蜡。淡水贝壳不能用以上方法,应该将材料在3―5%氢氧化钾溶液里浸泡十几分钟。最后贴上序号,编好说明。 (3)蟹标本的干制 先挖蟹肉,将头、胸甲脱开,用一头扁形的铁丝挖去体内的肉,再挖净螯足和步足的肉。然后在蟹的螯足和步足内穿入18或20号铅丝,将丝的一端通入肢尖处,另一端集中在胸腹部缠绕扎牢,再由腹部穿出两根铅丝,作为支撑架,固定在底盘上。将穿入铅丝的蟹放在解剖板上,用大头针固定步足。然后用毛笔涂上福尔马林,用注射器向肢间注入少量16%甲醛防腐。将标本阴干,最后用乳白胶粘上头胸甲后,按身体颜色用油画颜料将标本上色。 2.动物浸制标本制作 [1]整体浸制标本 整体浸制标本的制作过程是:选择材料,处死,整理姿态,防腐固定,装瓶保存,编号,记录和粘贴标签等。方法简便,容易制作。 (1)选择材料 应选择大小适中的动物个体。鱼类尽可能选新鲜的,保持鳍、鳞等的完整。两栖、爬行动物活体应装入密闭的容器中,同时放入浸有乙醚的棉球使其麻醉致死。 (2)整理姿态 待动物麻醉至死后取出,用清水冲洗体表的粘液,然后进行编号,登记和记录,并将标签系好。随即在腹腔内注入适量福尔马林以固定内脏器官,鱼类将背鳍、胸鳍和尾鳍适当展开,用回形针将塑料薄片或厚纸片与鱼鳍夹在一起,使其展开呈生活状态。两栖类整理成生活时的匍匐姿态。并将指、趾展开。整理两栖类时,先用镊子将一团脱脂棉塞入口腔,使其张开,以便观察牙齿。将其身体盘成螺旋状,使其头部在上,或者将其折成“S”形,龟和晰蜴的四肢,应用大头针固定在腊盘上。 (3)固定保存 用福尔马林浸泡固定体内组织。待固定好后,再将标本用白线固定在大小适宜的玻璃片上,放入适当的标本瓶中,加入福尔马林浸泡保存。 [2]动物各系统标本浸制 系统标本浸制的关键是需浸制系统的解剖和处理,下面以家兔的生殖系统标本浸制为例介绍具体制作方法。 (1)取材 选择成年的雌、雄家兔,割断颈动脉,放血杀死。 (2)解剖 将剥去皮的家兔冲洗干净,放在解剖板或盘上,剖开腹部。除去骨盆肌更好地露出耻骨和坐骨。用骨钳在耻骨、坐骨全长的中心将其切断,取出排泄生殖系统。取出后所剩头、胸部材料不要弃掉,可以制作呼吸系统标本。 雌兔的生殖系统:卵巢一对,呈扁椭圆形,由特别的系膜挂在腹腔背面的两侧。输卵管是挂在系膜上的一对弯曲细管,前端成漏斗状,跟腹腔相通。每一根输卵管的后端扩大而成子宫。左右两侧子宫融合于阴道。生殖孔是宽阔的纵裂隙,以阴唇为周界,所以要切去周围少量体壁,才能取出全部泄殖系统。 雄兔的生殖系统:睾丸一对,白色,呈卵圆形,每一个睾丸的背侧有附睾。输精管是细长的管道,从睾丸发出,经过腹股沟管进入腹腔,开口于尿道,尿道在耻骨联合背侧进入阴茎。尿道的背侧还有精囊腺和前列腺。阴茎由两个海绵体组成。除去海绵体周围的体壁,就能取出全部泄殖系统。 (3)定形 插入标本瓶内玻璃片的阔度,将取出的雌、雄生殖系统依次排列在解剖板上。用福尔马林液浸泡。 (4)修整保存 将标本用水漂洗,放在解剖板上剪去多余组织。固定在玻璃片上、装瓶,同前。

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